Trece años antes que en México y diez después que en Guanajuato, Guadalajara comenzó con la observación metereológica y astronómica diaria en 1874, cuando el profesor Lázaro Pérez, químico y naturista de profesión, estableció un observatorio en su casa habitación, localizada en la calle Santa Teresa (hoy Morelos) a dos cuadras al poniente de catedral; este observatorio duró en la finca hasta 1885. En el Hospital Civil de Belén, estando como director Perfecto Bustamantes, se fundó otro observatorio en 1887, el cual estuvo en servicio hasta 1898 y era atendido por estudiantes entrenados para ello.En tiempos de la gubernatura de Ramón Corona se hicieron los planos para la erección de un observatorio en la Escuela de Ingeniería, que se encontraba en el antiguo Colegio de San Juan (hoy cine Variedades), pero el asesinato del gobernador hecho por Primitivo Ron, modificó el proyecto a sólo una adaptación.

Pero en 1890 quedó por fin fundado el Observatorio del Estado a iniciativa del ingeniero Agustín Pascal, quien fue su director.

Este observatorio funcionó hasta 1899, reapareciendo en 1901, pero en vez de radicar en la Escuela de Ingenieros pasó a los altos del Teatro Degollado, en uno de sus balcones de la última fila por la parte norte.
Ya en el Degollado, fue regenteado primero por un señor de apellido Nieto y después por un personal muy competente, bajo la dirección del ingeniero J. Enríquez. El observatorio del palco del teatro pasó a la azotea del mismo en 1906, porque se le equipó con aparatos nuevos y modernos, y ahí tuvieron la asesoría del ingeniero Manuel E. Pastrana, director del Observatorio Central de México.

En 1913, pasa del Degollado a su antiguo local de San Juan a la ya fundada Escuela Libre de Ingenieros, estuvo en servicio hasta 1925, porque se le incorporó a la Universidad de Guadalajara, el Observatorio del Estado y pasó a ocupar un local, en aquel tiempo, a las afueras de la ciudad (junto a los Arcos). El clero establece un observatorio en 1903, en el edificio del Seminario Mayor (hoy XV zona militar).

El encargado de instalar los aparatos metereológicos y astronómicos en el techo de este edificio, fue el Pbro. Severo Díaz; este centro de observación duró hasta 1914, cuando el gobierno constitucionalista tomó posesión del inmueble, transformándolo en cuartel. Aproximadamente entre los años de 1890-1891, se instala un observatorio en el Palacio de Gobierno, siendo atendido en forma muy deficiente, según nos cuenta un documento de antecedentes que tiene el actual Instituto de Astronomía.

El Instituto de Astronomía y Metereología (a un lado de los Arcos), fue edificado en 1926 durante el gobierno de José Guadalupe Zuno, tiene un área de tres mil metros cuadrados y sólo 784 metros cuadrados de construcción. Tiene además el honor de ser la primer dependencia que tuvo la Universidad de Guadalajara.
Este centro de investigación ha estado día y noche en el estudio del cielo y los fenémenos naturales, prácticamente desde su fundación. El edificio se encontraba en aquellos tiempos fuera de la ciudad, puesto que Guadalajara llegaba aproximadamente hasta el cruce de Av. Enrique Díaz de León y Vallarta; a finales de los 30's los únicos edificios construidos eran este observatorio, el Club Campestre o Country Club y pocas residencias de los tapatíos que buscaban soledad y silencio.

Estaba rodeado de llanos sembrados de maíz, donde sólo se vislumbraba la carretera Panamericana, la México-Guadalajara y la de Barra de Navidad-Guadalajara; el único medio de transporte que llegaba hasta ese "apartado lugar", era un tranvía que era casi exclusivo para el servicio de los socios del club.
A este bello edificio que alberga al instituto, se le dotó con un telescopio fabricado en Londres a principios de siglo; este instrumento se lo compraron al ingeniero Salvador Ugarte y es de 12 centímetros de diámetro (5" de apertura). Este telescopio refractor se bajó hace cinco años y ahora se encuentra en exhibición dentro del mismo edificio, junto con un barógrafo fabricado por la firma Jules Richard, de París y data de principios de siglo; también está un bello barómetro hecho en Londres, un reloj sideral con péndulo de mercurio también de fabricación inglesa y otro barómetro.

Desde la inauguración del observatorio, estuvo como director el Pbro. Severo Díaz, el cual llevó la batuta de esta institución hasta el 14 de septiembre de 1956, día en que falleció. Continuó el trabajo del padre Díaz el licenciado Arie Villegas, le siguió el profesor Pablo G. Franco hasta su jubilación en julio de 1975. En 1976 le tocó el turno al ingeniero Enrique Flores, hasta el 30 de mayo de 1992.

De mayo a septiembre del mismo año estuvo a cargo del instituto el doctor Francisco Villalpando Ibarra y el 15 de septiembre de 1992, quedó este observatorio a cargo del señor Rogelio García Castro, secretario del instituto y encargado del despacho y hoy, es atendido por Valentina Davidova. Este inmueble tuvo una reestructuración muy importante en 1986, ya que los temblores de septiembre de 1985, provocaron que algunas columnas sufrieran coarteaduras y se consideró de alto riesgo mantenerlas de esa manera; así que se le dio paso a fortificar el edificio y también se le construyó un entresuelo para aprovechar al máximo el espacio de las oficinas y despachos.

En este tiempo, prácticamente la mancha urbana se tragó a este instituto y es difícil observar las estrellas, porque la gran contaminación del aire, las luces artificiales, etc., no son propicias para la investigación sideral. Por este problema, la observación de cielo la llevan al cabo con telescopios portátiles, que sitúan a las afueras de Guadalajara. Lo que se refiere a la meteorología, este instituto posee una computadora que sirve para obtener imágenes metereológicas vía satélite, las cuales van sacando cada media hora para tener un análisis claro de los cambios atmosféricos en el país.

Por el problema de ya no poder observar a un 100 por ciento el cielo, se ha construido un observatorio en Cuxpala (municipio de Tala), en un terreno donado por el ayuntamiento durante el gobierno de Flavio Romero de Velasco. Actualmente este inmueble ya está terminado. Este nuevo observatorio alberga un telescopio (pesa tonelada y media) Schmidt-Cassegrain con espejo de 62 centímetros (el mayor del occidente de México) y montura de yugo. Realmente resulta interesante saber que este observatorio, va a ser el primero en la República que trabajará con energía solar.